Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPCAMP16422 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms