Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRG2P13727 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRG2P13727 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms