Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GP1BBP13224 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms