Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDH1P12830 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDH1P12830 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH1P12830 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH1P12830 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH1P12830 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDH1P12830 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDH1P12830 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms