Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RALAP11233 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RALAP11233 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RALAP11233 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms