Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GLI3P10071 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GLI3P10071 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GLI3P10071 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms