Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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