Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALUO43852 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALUO43852 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CALUO43852 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALUO43852 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms