Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTDSP2O14595 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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