Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms