Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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