Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms