Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms