Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC180Q9P1Z9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms