Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EHD3Q9NZN3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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