Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TREX1Q9NSU2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms