Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms