Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDE7BQ9NP56 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms