Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM54Q9BYV2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM54Q9BYV2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms