Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms