Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF6Q9BYE7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF6Q9BYE7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms