Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms