Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC11Q9BVV2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms