Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTKNQ9BST9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms