Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BPIFA3Q9BQP9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPIFA3Q9BQP9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms