Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM227BQ96M60 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM227BQ96M60 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms