Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LCORQ96JN0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms