Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM12Q96EX1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms