Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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