Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAF2Q96CS3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms