Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRUQ92729 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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PTPRUQ92729 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PTPRUQ92729 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PTPRUQ92729 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PTPRUQ92729 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PTPRUQ92729 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
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PTPRUQ92729 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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