Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN4Q92575 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms