Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H3Q8IVL6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H3Q8IVL6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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