Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME9Q86XW9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME9Q86XW9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms