Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms