Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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USP34Q70CQ2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP34Q70CQ2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP34Q70CQ2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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