Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEM1Q6ZVN7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEM1Q6ZVN7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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