Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDF6Q6KF10 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms