Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms