Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPROQ16827 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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