Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACKR1Q16570 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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