Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCN9AQ15858 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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