Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRADDQ15628 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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