Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NCAPHQ15003 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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