Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms