Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A3Q14050 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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