Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2Q13563 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
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