Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HDAC1Q13547 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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