Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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