Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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